少女成濑顺（水濑祈 配音）有着一段不堪回首的童年往事，曾经，年少无知的她因为口无遮拦，导致了家族的悲剧，而她本人亦被封印了言语，无法再开口说话。这样的顺终日生活在悲伤之中，和所有人都保持着距离，紧紧的关闭上了心门。 某一天，浑浑噩噩迷迷糊糊的少年坂上拓実（内山昂辉 配音）、因为受伤而无法完成棒球梦想

幕府时代末期，外忧内患，山河动荡，百姓生活困苦，且生命时刻受到威胁。少年心太因其善良纯洁之心感动飞天御剑流高手比古清十郎，被其收入门下学习剑法，更名剑心。在国家危难之际，年轻的剑心怀揣改变时代的梦想下山，加入奇兵队，日后更被桂小五郎纳入麾下，以刽子手的身份为时代的变革尽一份绵薄之力。年仅15岁的剑心

明治政府建立二十余年，新时代虽已来临，却似乎与人们心中——尤其是维新志士心中的那个理想国度相差甚远。国家仍处在大时代的动荡惶恐之中，战争的阴影仍笼罩在日本的上空。当年的浪漫剑客如今纷纷尘埃落定：弥彦成长为正直善良的剑客；左之助也少却了青春孟浪，变得沧桑；剑心的儿子剑路同样拜入比古清十郎的门下，誓要成

「光明之心」的故事始于某一天，一位神秘少女辉夜在温达利亚岛的海岸上被男主角里克发现，其后更发现她的记忆和感情均已失去，而通过与岛上居民进行心灵交流，辉夜也一点点地取回了感情。与此同时，本身和平的温达利亚岛却引来了大量的海贼，原来这些海贼的目的都是想拿走辉夜颈上戴着的灵石。为了帮辉夜取回她的记忆和感情

本作品描述主角健太郎（けんたろう）与结城瑞穂为首的女主角们之间的恋爱故事，酌取和《同级生》相同类型的基本剧情与地图移动式冒险的系统，游戏内时间设定为1年，尝试描写出关系慢慢加深的爱情之作品。然而该尝试在玩家立场来看，无法否定游戏时间的漫长造成出疲惫感之破绽。此外，不用攻略本来玩的话难度相当高，这点也

主要描写主角山口刚和女主角南里爱与饭岛美雪的关系，并交错展开与持田真歩子、加纳凉子、神山みこ、新藤丽子等人的插曲。在TVA版比主角年幼的南里爱、饭岛美雪、持田真歩子的登场次数变多，就这点而言成为真正的“下级生”。

人々を怯えさせる連続殺人事件が発生、その現場にはいつも花の絵が残されていた。クオン（声：神谷浩史）たちは、事件に“能力者”＝“ベスティア”が関わっていると考える。一方、サイボーグ部隊WTOCの1人イプシロン（鳥海浩輔）もこの事件を追っていた。クオンは、事件現場にいつもかすかに残される甘い匂いに気づく

能力者の少年を確保しようとしたテイとサイボーグのイプシロン（瞬）が接触する。 なんとか少年とテイの救出には成功するが、テイは意識を失い倒れてしまう。 そしてその異変はイプシロンの体にも起きていた。 イプシロンと繋がったテイの脳波を辿り、クオンたちベスティアの本拠を探ろうとするクーストース。 ファンタ

クーストースがファンタジアム・ガーデンの存在を察知する。クオン（声：神谷浩史）はテイ（名塚佳織）を守るため、サイボーグ部隊WTOCと対峙する。そのとき、サイボーグ部隊のイプシロン（鳥海浩輔）に異変が起こる。異変を知ったクーストースの指揮官・上代（三木眞一郎）は冷酷にも、イプシロンを破壊する命令を下す

特殊能力を発揮する少年少女たち能力者“ベスティア”の組織アトラクターの拠点ファンタジアム・ガーデンから脱出したイプシロン（声：鳥海浩輔）とベスティアたち。彼らを追って、ベスティア排除組織クーストースのサイボーグ部隊が出動する。行方不明となったアトラクターの中心人物クオン（声：神谷浩史）は、果たして生